Главной целью Ассоциации является содействие развитию и совершенствованию гомеопатического средства лечения в Украине, информирование врачей различных специальностей, а также широких слоев населения о возможностях гомеопатии. Взаимообмен опытом, достижения взаимопонимания между различными направлениями в гомеопатии путем координации интеллектуальных, экономических, финансовых, производственных ресурсов членов Ассоциации. Социальный, правовая защита и юридическая поддержка врачей-гомеопатов и провизоров-гомеопатов. Развитие отношений с международными гомеопатическими организациями, проведения конференций, симпозиумов, семинаров, в том числе на международном уровне. Содействие развитию гомеопатической фармации в Украине, внедрению и производству гомеопатических препаратов. Широкое привлечение общественности Украины к гомеопатической профилактики и лечения для улучшения общего уровня здоровья населения.