Общественная организация «Ассоциация бариатрической хирургии» создана  на базе Национального института хирургии и трансплантологии 23 января 2001 года. (Институт клинической и экспериментальной хирургии) с целью содействия и распространения методов бариатрической хирургии, максимальной реализации творческого потенциала, защита интересов ее членов.

Первые операции по хирургическому лечению ожирения в бывшем Советском союзе были выполнены в институте академиком А.А. Шалимовым в 1976 году, это были операции еюноилеошунтирования, предусматривающие выключение из пищеварения большего участка тонкой кишки. В дальнейшем в стенах института впервые в Украине выполнены операции бандажирования желудка (80е годы), операция Билиопанкреатического шунтирования (2000 год), операция шунтирования желудка (2001 год).
С 2000 года широко внедряются миниинвазивные методы лечения ожирения.

С 2001 года Ассоциация бариатрической хирургии является полноправным членом международной федерации хирургии ожирения (IFSO).